發(fā)布日期：2020-08-23
摘要
2020年8月23日，佑安醫(yī)院婁金麗團(tuán)隊(duì)和清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院郭永團(tuán)隊(duì)合作，在Clinica Chimica Acta 發(fā)表題為 “Comparison of qualitative and quantitative analyses of COVID-19 clinical samples” 的文章。該文章使用逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)熒光定量PCR（RT-qPCR）和液滴數(shù)字PCR（ddPCR），從定性和定量的角度對(duì)入組的91例病例的樣本進(jìn)行了分析，重點(diǎn)探討了兩種方法針對(duì)COVID-19的診斷性能和適用性。
ddPCR顯示比RT-qPCR具有更高的靈敏度和更低的檢測(cè)下限，并且它能提供絕對(duì)定量，且并不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線，因此，對(duì)于COVID-19的研究和治療指導(dǎo)，ddPCR比RT-qPCR具有更大的優(yōu)勢(shì)。
研究背景
2019年末COVID-19疫情爆發(fā)以來，已經(jīng)感染了超2000萬人，并導(dǎo)致了超80萬人的死亡，是目前全球公共健康面臨的最大挑戰(zhàn)。在疑似病例的確診和排除中，病毒核酸檢測(cè)因快速、準(zhǔn)確、高靈敏的特性成為主要的診斷方法，目前主要以RT-qPCR和ddPCR兩種方法進(jìn)行樣本的定性和定量分析，它們?cè)贑OVID-19的診治、監(jiān)測(cè)、預(yù)防和控制中起著重要的作用。
方法與結(jié)果
本研究總共從30例確診COVID-19的患者和61例疑似排除患者中收集了117個(gè)樣本，分別使用RT-qPCR和ddPCR（新羿生物）對(duì)這些樣本進(jìn)行定性和定量分析。對(duì)比發(fā)現(xiàn)：
1）RT-qPCR和ddPCR的陽性檢出率分別為93.3％和100％，ddPCR的結(jié)果和臨床診斷結(jié)果的一致性更高。
2）在這117個(gè)樣本中，有6個(gè)樣本經(jīng)RT-qPCR檢測(cè)為單基因陽性，但經(jīng)ddPCR鑒定為陽性，而3個(gè)樣本經(jīng)RT-qPCR檢測(cè)為陰性，但經(jīng)ddPCR檢測(cè)為陽性。這9例樣本均來自確診患者，并且樣本的病毒載量相對(duì)較低（3.1–20.5拷貝/測(cè)試），表明ddPCR比RT-qPCR具有更高的靈敏度和更低的檢測(cè)下限。
3）在46份陽性樣本中，有17份樣本（37％）的病毒載量低于20拷貝/測(cè)試，說明低拷貝標(biāo)本在臨床檢測(cè)中并不少見。
4）在一名重癥患者的動(dòng)態(tài)監(jiān)測(cè)中，來自該患者的所有6個(gè)樣本經(jīng)RT-qPCR檢測(cè)均為陰性，但其中4個(gè)樣本經(jīng)ddPCR檢測(cè)為陽性，這些樣本的病毒載量低，表明ddPCR更加靈敏。
研究結(jié)論
COVID-19是一種新的傳染病，有必要加深對(duì)該病的研究以更好地進(jìn)行疫情防控和診治。定量分析為研究團(tuán)隊(duì)提供了更多信息，可能會(huì)加深對(duì)于COVID-19的臨床理解。ddPCR顯示比RT-qPCR具有更高的靈敏度和更低的檢測(cè)下限，并且它能提供絕對(duì)定量，且并不依賴于標(biāo)準(zhǔn)曲線，因此，對(duì)于COVID-19的研究和治療指導(dǎo)，ddPCR比RT-qPCR具有更大的優(yōu)勢(shì)。
作者介紹
黨燕、劉寧和陳芊如為該研究的共同第一作者，婁金麗和郭永為該研究的共同通訊作者。
參考資料
Dang Y, Liu N, Tan C, Feng Y, Yuan X, Fan D, Peng Y, Jin R, Guo Y, Lou J. Comparison of qualitative and quantitative analyses of COVID-19 clinical samples. Clinica Chimica Acta. 2020, 510:613-616.
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