發(fā)布日期:2022-04-20
圖1 基于數(shù)字PCR的SMA檢測(cè)流程
圖2 本方法基于新羿生物的5色微液滴數(shù)字PCR系統(tǒng)進(jìn)行研發(fā)
為了驗(yàn)證方法的準(zhǔn)確性,作者收集了共317例不同類型的臨床樣本進(jìn)行檢測(cè),包括外周血、羊水、絨毛、口腔拭子和干血斑。在317例樣本中,共有22例患者、72例攜帶者和223例正常人(圖2),結(jié)果顯示該方法對(duì)于不同類型的樣本都能夠?qū)崿F(xiàn)目標(biāo)基因拷貝數(shù)準(zhǔn)確的檢測(cè)。此外,作者也觀察到了SMN2基因拷貝數(shù)更多的SMA患者具有更輕的表型;通過(guò)對(duì)目標(biāo)基因的同時(shí)檢測(cè),亦觀察到患者、攜帶者和正常人群中都出現(xiàn)基因轉(zhuǎn)換而產(chǎn)生融合基因的情況。
與現(xiàn)有的檢測(cè)方法如限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Restriction fragment length polymorphism,RFLP)和熒光定量PCR(Quantitative PCR,qPCR)相比,本方法能精準(zhǔn)檢測(cè)更多靶標(biāo),且對(duì)模板量要求低(≥ 1.5 ng);與金標(biāo)準(zhǔn)方法多重連接探針擴(kuò)增(Multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)相比,本方法檢測(cè)周期更短(首次出結(jié)果24 h vs 2.5 h)、操作更簡(jiǎn)單、對(duì)模板量的要求低和適用于更多種類型樣本。
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https://doi.org/10.1021/acs.analchem.1c04403
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